數十年前，藍星上毫無征兆地湧現出眾多形形色色的生物，瞬間引發全球恐慌，致使人類數量急劇減少
與此同時，也有不少的生物選擇加入人類的一方，幫助人們守衛家園
慢慢地，人類發現，不管是入侵的生物還是幫助人類的生物，都能化作卡牌，從而更方便地為人類使用
漸漸地，隨著入侵生物基本被消滅殆儘，人類已經能夠將卡牌中的怪獸召喚出來投入戰鬥
時光流轉，人們逐步構建起一套完備的決鬥體係
就在這時，地星上一位資深的遊戲王玩家穿越至此……